南开大学出版社出版科承担着实现由科学文化知识物化为物质文化产品过程的职责。它以"严格控制图书生产成本，提高图书生产质量，缩短图书生产周期"为工作原则，起着对内服务于编辑部和市场营销部，对外协调社厂业务关系的作用。出版科具体负责新版书由发排到付印、重版书承制直至产品入库的全部生产工作，同时负责生产原材料的购置入出库以及图书产成品质量查验、生产加工费核算计价、图书出版汇总统计等工作。出版科现编制４人，设科长１人、图书承制员３人。
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